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2008/9/25

「您所不知道的Ovid Medline」系列之MeSH比對

Ovid Medline最大的特色,除了使用Ovid最新檢索引擎OvidSP外,就是提供Thesaurus(索引典)的功能,主動協助使用者進行醫學標題詞(MeSH)的比對,也就是所謂的控制詞彙功能,讓使用者輕輕鬆鬆精確檢索到所需文獻資料。


這樣的關鍵性的控制詞彙檢索功能絕對是各家出版商建置自有平台的Medline時必然要融入的功能;只是,您可能不知道各家平台所建置的Thesaurus功能卻不盡相同!


MeSH測試比較一:粒線體夏娃

舉個最近圖書館好友提的一個主題為例,她說她想查詢探討「粒線體夏娃(Mitochondrial Eve)」的文獻,但進入不同的Medline平台去查詢,每個平台列出的參考醫學標題詞都不同,究竟哪個平台比對出來的比較精準呢?

在做任何評斷之前,我們先來瞭解一下什麼是粒線體夏娃。

Mitochondrial Eve叫做粒線體夏娃,或者稱為母系粒線體遺傳,或者稱為夏娃學說,是科學家追溯現代人起源地的一種方法(白話來說,就是追蹤祖宗十八代的來源)。粒線體是細胞內的發電廠,細胞除了有自己的DNA,科學家發現細胞內的粒線體自己也還有一段DNA,而這一段DNA就學者研究是由母系遺傳帶來。所以 Mitochondrial Eve的理論在研究上,學者可以藉由比對粒線體中的DNA排序的類型和方式,找出A和B是否有共同祖先以及彼此的演化關係。譬如想知道原住民和菲律賓某小島上的原住民是否有相同血緣,就可借由粒線體的DNA比對來探討彼此的血源關係有多深,甚至今天之所以演化分支為不同民族的話,其中的DNA突變又可能為何等等相關研究。

(詳細介紹可參考下面Wikipedia介紹 :http://en.wikipedia.org/wiki/African_Eve)

所以簡單來說粒線體夏娃探討的就是關於染色體與遺傳演化。 接著我們將Mitochondrial Eve輸入Ovid Medline與PubMed中查詢,所得到結果分述如下:

一、Ovid Medline:
由於粒線體夏娃並非標準醫學標題詞,所以Ovid系統會自動列出所有與染色體、進化、基因、物種發展等相關的醫學標題詞供讀者參考選擇。

二、PubMed MeSH Database:
同樣地,由於粒線體夏娃並非標準醫學標題詞,所以系統直接告訴使用者,資料庫沒有找到任何結果。雖然PubMed還是提出了建議的醫學標題詞,但列出的標題詞都只是詞彙中有包含到 Mitochondrial 或 Eve的標題詞,甚至列出了許多與DNA演化無關的醫學標題詞。

為什麼同樣為醫學標題詞比對,兩者結果卻不一樣呢?其實最大的差異點就在於系統究竟是如何處理我們所輸入的詞。

OvidSP 背後端建置有一套非常強大的專業詞庫,系統會將我們所輸入的詞彙導入字詞庫中分析字意,同時系統還會找出在資料庫中有包含這個主題的文獻,並且去統計這些文獻中最多相關的MeSH主題是哪一些個。因此,可以看到Ovid第一個找出的是演化(Evolution),第二個是DNA, Mitochondrial,依序分別是遺傳醫學、種系發展(Phylogeny)、突變(Mutation)、血統(Pedigree)、分子層面的演化、遺傳異質性(Genetic Heterogeneity,不同的致病基因引起相同的遺傳病特徵的情形)、基因重組(Recombination, Genetic)和基因型(Haplotypes)等與Mitochondrial Eve相關的醫學標題詞,所以讀者可以藉由系統的提示選擇最適合的查詢主題。

反觀PubMed處理使用的輸入的詞彙,僅進行單純的字碼比對,並非落實控制詞彙查找,也就是如果標題詞中查不到跟使用者輸入的詞彙相同者,PubMed系統就會將使用者輸入的字詞一個個分開去比對醫學標題詞中,有哪些標題詞有包含到使用者輸入的單字,然後一一列出做為檢索的建議。

 

MeSH測試比較二:注意力不足過動症
我們再試試查詢其他比較熱門的用詞好了,心理學經常探討的ADHD(Attention Deficit Hyperactivity Disorder;注意力不足過動症),很有趣的結果產生了:

在PubMed MeSH Database中,比對到的ADHD是一個藥物相關的醫學標題詞:

而Ovid Medline則確實列出了ADHD的醫學標題詞Attention Deficit Disorder with Hyperactivity:

面對上述兩個非常熱門的Medline資料庫出現這樣迥異的結果情況,我們不免思索的是市面上號稱免費的 Medline資料庫,又會有什麼樣的比對呈現呢?是否也能比對到使用者真正要查詢的醫學標題詞呢?還是查不到任何有關標題詞?查到一堆無關的標題詞呢?充滿好奇心的您,不妨試試馬上看目前圖書館所使用的各家Medline吧!

2007/8/20

運動傷害左右一生

旅美棒球投手郭泓志在上個月5日因為左手肘受傷二度被球隊列入傷兵名單。這是小小郭職棒生涯中的第四次開刀,儘管開刀過程非常順利,目前也在恢復當中,但是當他受傷消息傳出的第一時刻,著實讓人為他捏了一把冷汗,因為我們都擔心這麼有天分的球員會不會因為反覆的運動傷害而被迫提早離開他人生最熱愛也最燦爛的舞台,若真的如此,可是令人感到相當可惜!

所幸,目前小小郭的復原狀況相當理想,日前也進場練投,儘管目前仍被球隊列入本季傷兵名單,但意志力強烈的他,勤做復健與練投,用實際行動積極爭取重返球場為隊伍爭取勝利!

運動傷害的問題可大可小,或許就只是受個小傷,過個幾天就能復原,但也可能因為長期的反覆傷害造成終身的遺憾!美國國家醫學圖書館主席也特別以運動傷害做為專欄的探討主題之一。

本期我們利用剛更名為Clin-eguide(原資料庫名稱為ClinicalResource@Ovid)做為資訊搜詢的範例。

如果想查詢是否文獻上有相關治療手肘骨刺的醫療資訊,我們可以簡單將我們的問題輸入系統(Clin-eguide有別於其他資料庫的先進檢索方式:自然語言):How to treat and rehabilitate bone spur in elbow?然後點選SEARCH。


透過Clin-eguide臨床決策支援系統的整合查詢功能,我們只輸入一次關鍵問題,系統便幫我們一口氣從各類型資料來源(如MEDLINE醫學研究資料庫、會議論文、實証醫學研究資源、藥物資訊、護理參考資源、病患衛教、臨床指引…等)撈回相關結果:


其中,電子書ACSM's Primary Care Sports Medicine中指出,對於可疑患者,可以透過電腦斷層掃描(CT)或核磁共振攝影(MRI)可以幫助治療診斷做有效的判斷。就手肘骨刺治療方式來看,不免還是需要利用外科手術方式取出骨頭碎片或是突出物。


而同篇文中也探討到投手如何保護自己的手肘。


我們再試著查詢運動員運動傷害的相關研究報導。在系統中輸入:Are there any researches about sports injuries on athlete? Clin-eguide從各個資料庫查出結果,例如:

1、在EBMR實証醫學資料中曾經探討過,保守治療法對於肩關節向前脫位外傷狀況減少的研究。


2、MEDLINE中所收錄關於平衡能力與運動訓練以及運動傷害風險之間的關係研究


3、CINAHL收錄從實証醫學角度,針對美國北卡羅萊納州高中的運動傷害狀況做研究:


您對本期的主題是否有興趣,想進一步了解目前醫學上的研究成果與體驗Clin-eguide查詢的便利性嗎?請立即點選此申請Clin-eguide試用!

2007/7/22

肺結核-活化石級的新公共衛生議題

您知道從今年7月1日起,凡是具傳染能力的肺結核病患,都必須延遲搭乘八小時以上的飛機;而具有多重抗藥性肺結核的病患,則不被允許上飛機。印象中,肺結核好像是讀書時在紅樓夢中看到咳血的黛玉,又或是淒涼的茶花女。實際上,肺結核是台灣地區因傳染病致死的第一名,肺結核已經很快的入侵我們的生活。

肺結核是已經存在已久的傳染病,在目前可以查詢的文獻紀錄中,Medline中收錄最早的文獻來自於1948年,而在Global Health中,最早的文獻則來自於1912年。這真可說是活化石級的傳染病。而為什麼醫學越來越發達的今天,我們依然無法有效抵抗肺結核呢?!相信歷年的文獻資料可以給我們一個完整的回顧。

由於5月底美國發生一名超級抗藥性(XDR)結核病患,違規搭乘長途飛機到歐洲,引發世界各國再度重視起肺結核這個聽起來古老,但是已經成為最新的公共衛生議題的疾病。這個案例不但使美國政府發出44年以來第一次的強制隔離令,令大眾再度重視起2006年由世界衛生組織提出有關「傳染性肺結核病患應延遲搭機」的建議。在2007年6月15日的Medline Plus中,也同時針對這個主題提供了詳細的資料,供大眾了解這個活化石級的新世紀傳染病。

在國內,衛生署疾病管制局則是在6月底發布命令,規定自今年(民國96年,西元2007年)7月1日起,「傳染性肺結核病患」應延遲搭乘八小時以上長途飛機,「多重抗藥性(MDR)肺結核病患」則無論航程時間長短,均應延遲飛行計畫。違反者可依傳染病防治法第66條,處以新台幣1萬元以上15萬元以下罰鍰。

結核病同時和愛滋病、瘧疾並列為目前WHO重點防治的三大疾病之一。這三種疾病每年造成600萬以上的人類死亡,而這個數字還在不斷攀升中;更由於國際交流頻繁、交通工具的發達、都市化的生活型態和老人化社會的演進,不論是所謂的第三世界國家或是先進國家,都必須面對這三種疾病的威脅與挑戰。因此,當我們在規劃相關公共衛生措施與頒布政策之前,更需要了解國際上針對這個議題的對策,和世界一起面對這些疾病的挑戰,更要能夠從其他地區的經驗來作為推行政策時的依據。

這時候,研究人員除了基礎與臨床醫學的角度來查詢相關資料外,更需要從全球唯一的公共衛生資料庫Global Health來幫助我們獲得更充足的資訊。在Global Health中,我們可以查詢從1910年到現在,來自全球超過125個國家所發表的期刊、專書、報告、論文集等相關文獻的索引摘要資料。

以Tuberculosis為例來分別查詢Medline與Global Health中收錄的資訊。在Meldine中我們可以找到最早的文獻是在1948-1949年出版的文獻,內容從如何醫治病患個人健康為出發點。(如圖一)
圖一


在Global Health中,則是最早可以回溯到1912年6月份,刊登在Philippine Jl. of Science期刊,內容則是以疾病如何傳播以及透過流行病學的角度來做觀察。(如圖二)
圖二


而從1911年到1949年將近40年中間,我們可以在Global Health資料庫中找到10692筆的文獻資料,其中包括9378筆的期刊文獻、588筆的書或書中章節資料和其他包含會議論文集、博碩士論文、年度報告等759筆的資料。這些資料都是我們在Medline所找不到的資訊。(如圖三)
圖三


若是我們統計所有與Tuberculosis相關的文獻資料,從最早到2007年7月為止,在Medline中收錄有145859筆資料,在Global Health中有44899筆資料,兩者相加超過有19萬筆記錄。若是單單以2007年1月到7月的資料來比較,扣除掉重複收錄的文獻紀錄,Global Health中有221筆資料,超過15%的文獻是獨家收錄在Global Health中的,其中內容多數是以疾病傳播方式、流行病學調查等從公共衛生的角度來發表的文獻資料。(如圖四)
圖四


由於有了Global Health的相輔相成,當我們需要做公共衛生課題的研究時,可以有更充裕的資料來源,不但可以以古鑑今,也不會重蹈覆轍。此外,Ovid在同一介面上的Journals@Ovid和Books@Ovid,也提供許多公共衛生的期刊或電子書資源,電子書部份包括榮獲Doddy五顆星評價的Hospital Epidemiology & Infection Control,還有Medical Epidemiology、Oxford Handbook of Tropical Medicine等知名書籍;電子期刊則包括有American Journal of Epidemiology、American Journal of Public Health、Epidemiology和Journal of Epidemiology & Community Health等期刊。提供讀者可以一次查詢資料庫、電子書和電子期刊的環境。

附註1:請點選此處查閱最新電子書清單
附註2:請點選此處查閱最新電子期刊清單

2007/6/17

貼近讀者、實現互動 Ovid知識+電子報起跑

從單機光碟版一直到現在,Ovid利用其優秀的搜尋技術以及以讀者為中心的設計概念,從醫學資訊的領航者一直擴展到線上電子資源的巨擘,將困難複雜的技術隱身在簡單明瞭的檢索介面之下,提供所有的讀者利用Ovid的平台作為通向無垠智識網路的窗口。現在,我們將更進一步,透過Ovid知識+電子報的平台,與您分享更多使用者的經驗,透過互動式平台的實務分享和國內外的實例簡介,讓您看到更豐富的Ovid、更嶄新的Ovid。

在Ovid知識+電子報中,每期我們會從讀者的角度,固定推出焦點資訊、新知分享、檢索功能與特色、實例探討與常見問題集五個專欄,提供不同角度來貼身了解現在的OvidSP。

焦點資訊︰提供當月最熱門的資訊,以及在Ovid介面上的實際運用。

新知分享︰包含新書簡介和相關電子資源的介紹,並提供試用資訊。另外,分享國內外使用Ovid線上資源的經驗,讓讀者可以快速了解相關的資源內容和實際應用層面的廣泛度。

檢索功能與特色︰由於網路技術的快速發展和檢索技術的不斷演進,Ovid持續的提供最實用的功能來協助讀者在最短的時間內可以最多最精準的資訊,在這個專欄裡我們將一一呈現。

實例探討︰所有的介紹與特色莫過於透過實際的演練讓讀者可以一目瞭然。

常見問題集︰如何知道Medline收錄幾篇台灣作者發表的文獻資料?如何找到想要的基因圖譜圖片?如何製作期刊目次內容服務?您發問,我解答,讓您使用Ovid更得心應手。

歡迎您訂閱Ovid知識+電子報,敬請拭目以待。