「您所不知道的Ovid Medline」系列之MeSH比對

Ovid Medline最大的特色，除了使用Ovid最新檢索引擎OvidSP外，就是提供Thesaurus（索引典）的功能，主動協助使用者進行醫學標題詞（MeSH）的比對，也就是所謂的控制詞彙功能，讓使用者輕輕鬆鬆精確檢索到所需文獻資料。

這樣的關鍵性的控制詞彙檢索功能絕對是各家出版商建置自有平台的Medline時必然要融入的功能；只是，您可能不知道各家平台所建置的Thesaurus功能卻不盡相同！

MeSH測試比較一：粒線體夏娃

舉個最近圖書館好友提的一個主題為例，她說她想查詢探討「粒線體夏娃(Mitochondrial Eve)」的文獻，但進入不同的Medline平台去查詢，每個平台列出的參考醫學標題詞都不同，究竟哪個平台比對出來的比較精準呢？

在做任何評斷之前，我們先來瞭解一下什麼是粒線體夏娃。

Mitochondrial Eve叫做粒線體夏娃，或者稱為母系粒線體遺傳，或者稱為夏娃學說，是科學家追溯現代人起源地的一種方法（白話來說，就是追蹤祖宗十八代的來源）。粒線體是細胞內的發電廠，細胞除了有自己的DNA，科學家發現細胞內的粒線體自己也還有一段DNA，而這一段DNA就學者研究是由母系遺傳帶來。所以 Mitochondrial Eve的理論在研究上，學者可以藉由比對粒線體中的DNA排序的類型和方式，找出A和B是否有共同祖先以及彼此的演化關係。譬如想知道原住民和菲律賓某小島上的原住民是否有相同血緣，就可借由粒線體的DNA比對來探討彼此的血源關係有多深，甚至今天之所以演化分支為不同民族的話，其中的DNA突變又可能為何等等相關研究。

(詳細介紹可參考下面Wikipedia介紹 :http://en.wikipedia.org/wiki/African_Eve)

所以簡單來說粒線體夏娃探討的就是關於染色體與遺傳演化。 接著我們將Mitochondrial Eve輸入Ovid Medline與PubMed中查詢，所得到結果分述如下：

一、Ovid Medline：
由於粒線體夏娃並非標準醫學標題詞，所以Ovid系統會自動列出所有與染色體、進化、基因、物種發展等相關的醫學標題詞供讀者參考選擇。

二、PubMed MeSH Database：
同樣地，由於粒線體夏娃並非標準醫學標題詞，所以系統直接告訴使用者，資料庫沒有找到任何結果。雖然PubMed還是提出了建議的醫學標題詞，但列出的標題詞都只是詞彙中有包含到 Mitochondrial 或 Eve的標題詞，甚至列出了許多與DNA演化無關的醫學標題詞。

為什麼同樣為醫學標題詞比對，兩者結果卻不一樣呢？其實最大的差異點就在於系統究竟是如何處理我們所輸入的詞。

OvidSP 背後端建置有一套非常強大的專業詞庫，系統會將我們所輸入的詞彙導入字詞庫中分析字意，同時系統還會找出在資料庫中有包含這個主題的文獻，並且去統計這些文獻中最多相關的MeSH主題是哪一些個。因此，可以看到Ovid第一個找出的是演化（Evolution)，第二個是DNA, Mitochondrial，依序分別是遺傳醫學、種系發展(Phylogeny)、突變(Mutation)、血統(Pedigree)、分子層面的演化、遺傳異質性(Genetic Heterogeneity,不同的致病基因引起相同的遺傳病特徵的情形)、基因重組(Recombination, Genetic)和基因型(Haplotypes)等與Mitochondrial Eve相關的醫學標題詞，所以讀者可以藉由系統的提示選擇最適合的查詢主題。

反觀PubMed處理使用的輸入的詞彙，僅進行單純的字碼比對，並非落實控制詞彙查找，也就是如果標題詞中查不到跟使用者輸入的詞彙相同者，PubMed系統就會將使用者輸入的字詞一個個分開去比對醫學標題詞中，有哪些標題詞有包含到使用者輸入的單字，然後一一列出做為檢索的建議。

 

MeSH測試比較二：注意力不足過動症
我們再試試查詢其他比較熱門的用詞好了，心理學經常探討的ADHD（Attention Deficit Hyperactivity Disorder；注意力不足過動症），很有趣的結果產生了：

在PubMed MeSH Database中，比對到的ADHD是一個藥物相關的醫學標題詞：

而Ovid Medline則確實列出了ADHD的醫學標題詞Attention Deficit Disorder with Hyperactivity：

面對上述兩個非常熱門的Medline資料庫出現這樣迥異的結果情況，我們不免思索的是市面上號稱免費的 Medline資料庫，又會有什麼樣的比對呈現呢？是否也能比對到使用者真正要查詢的醫學標題詞呢？還是查不到任何有關標題詞？查到一堆無關的標題詞呢？充滿好奇心的您，不妨試試馬上看目前圖書館所使用的各家Medline吧！

公共衛生學者的左右手-Medline與Global Health

當我們在做資料收集時，無不希望可以儘可能的收集到完整的資料，能夠對研究主題作一個完整的回顧之後，從中找出別人沒做過的研究方向或是更深入的了解。此時，能夠有完整而豐富的文獻資料庫就會是我們很好的助手。

以往，我們會透過Ovid Medline來查詢所有生命醫學相關的資料，當我們做流行病學或是公共衛生主題時，自然也是想到Medline。然而Medline收錄的文獻都屬於期刊文獻，當資料以書籍或是會議論文形式出版時，我們就無法從Medline中獲得；公共衛生又是一個需要長期觀察的主題，如果需要1950年以前的資料，可能更難查詢。再加上Medline所收錄的期刊大多偏重於北美地區的刊物，當我們需要其他發展中國家或是其他地域的資料時，就顯得吃力了。

此時，Global Health就派上用場了，尤其在Ovid介面中，可以做到兩個資料庫一起查詢，一次的檢索得到從1910年開始遍及125國以上的所有文獻資訊，在文獻的深度、廣度與時間長度上，我們都可以得到很好的支持。

從人心惶惶的SARS風暴和禽流感威脅、以及捲土重來的肺結核，再看到甫爆發的美國豬肉含瘦肉精的問題，這些議題都讓我們將眼光從個人的健康進而關懷到社區乃至整個人類的層面。我們也發現，儘管遠至東歐的天鵝身上有禽流感病毒，都可以影響台灣人民的健康；就算只是搭乘飛機，都有罹患肺結核的風險；更別說鄰近地區如東南亞國家一旦發生SARS或相關傳染疾病，台灣也必須馬上做出對應的防疫措施。因此在公共衛生的領域中，資訊必須能夠來自全球各地；所涉獵的主題必須從個人到環境、從動植物到人體、從人類行為到社會型態，一個專業的公共衛生資料庫是刻不容緩的需求。

Global Health是全球唯一以公共衛生為主題所製作的資料庫，收錄主題廣泛，小至細菌、病毒生物體，大至群體的社區衛生等，都是收錄的範疇。



也因為CAB Internatinal屬於非營利的國際性組織，使它可以和眾多會員國家合作，發展並收集許多的資源。因此，在Global Health收錄的資料中包含有期刊、書本、以及眾多難以取得的灰色文獻，其中有45%的資料來自歐洲地區，北美地區佔26%，另外在亞太地區的文獻收錄也高達20%，套句知名網站的廣告詞，在Global Health中什麼都收、什麼都有、什麼都不奇怪！



以禽流感為例，我們同時在Ovid介面中查詢Medline和Global Health，可以得到4千餘筆的文獻資料，以Medline為主進行去重複(Remove Duplicates)，還有60%的獨家文獻資訊收錄在Global Health中。查詢出來的資料，又可以透過Ovid介面去直接連結取得全文或是查詢相關館藏，讓資訊的取得可以更快更方便。

給CR@OVID兩分鐘，它給您無憂仲夏！

6/19就是端午節，象徵著我們就要正式進入夏季了！這是一個可以盡情暢遊於陽光底下的美好季節！不過真的可以那麼無憂無慮嗎？這個問題值得我們再次思考。

其實無論是基於愛美、美白，或是健康的考量，醫學界總是呼籲大家要注意防曬，為的就是提醒大家直接暴露於紫外線輻射的時間越久，對人體的危害就越大！而上個月初美國國家醫學圖書館(NLM)主席針對此議題提出了建議，提醒大家在享受陽光的洗禮時，別忘了紫外線可能引起皮膚癌的危險性。

究竟皮膚癌產生的因素有哪些？

皮膚癌的病症？

臨床研究上是否有相關治療實證？

以上問題通通可以在短短兩分鐘內找到答案！

首先我們利用ClinicalResource@Ovid (CR@OVID)人性的檢索方式，直接將我們的問題輸入。(ClinicalResource@Ovid的使用者可以直接點選問題連結，直接看系統查詢研究文獻結果。)
1.What are the factors of skin cancer?


2.How to diagnose skin cancer?


3.How to treat skin cancer?


關於皮膚癌產生的因素，透過CR@OVID內所整合的多類型的資源(電子書、MEDLINE資料庫、實證導引...等)在在顯示太陽輻射中的紫外線是造成皮膚癌的主要原因，例如”Genetic Basis of Common Diseases, The”書中提到：「大多數的皮膚癌是由角質層細胞(keratinocytes)中產生的基底細胞癌(basal cell carcinomas; BCC)或是鱗狀細胞癌(squamous cell carcinomas; SCC )。…而其中陽光的曝曬是導致皮膚癌的最主要因素」。



MEDLINE資料庫收錄來自於Mayo Clinic Proceedings的一篇研究發表”Overview of Skin Cancer Detection and Prevention for the Primary Care Physician”提到基底細胞癌典型的症狀就是結節潰瘍型，即皮膚表面出現平滑皮染色硬化小結，外表毛細孔擴張可見，另外也可能是皮膚表面出現類似黑痣的黑色素瘤的症狀；鱗狀細胞癌的症狀則是出現粉紅色硬化皮或是鱗狀，逐漸發展成腫瘤、潰瘍或是結一層硬殼皮片。



在Cochrane Collaboration實證研究方面，發表一篇Interventions for basal cell carcinoma of the skin報告說明BCC一般做法是利用外科手術方式去除腫瘤，而以外科手術與射線治療(雷射)為最佳的治療方式，且失敗率相當低，其中根據追蹤研究發現，又以外科切除手術結果比雷射治療方式來的更好。術後復原狀況非常良好率，手術切除術約為87%，使用雷射治療手術則為69%。當然文中還提到治療BCC的其他手術方式，例如刮除術、冷凍手術、莫氏顯微圖像手術(Moh's Micrographic Surgery)、光動力療法（photodynamic therapy）…等等，但是由於這些實證個案數不夠多，無法推斷各種方法之間的效果差異。





相關皮膚癌的文獻很多，也分佈在不同主題形式的資料庫中。要如何快速地從多元資料庫中取得值得信賴的資訊，對於忙碌的醫護人員、研究者來說確實是種考驗。CR@OVID將電子書、MEDLINE、Guideline、期刊資源等透過系統連結機制，將所有資訊串連起來，再加上簡易的自然語言檢索方式，大大簡化使用者對於檢索策略的規劃，因此無論欲查詢基礎醫學理論、研究計畫或是實證證據等等，一口氣通通取得，無需切換資料庫、切換介面查詢資料，讓查詢變得輕而易舉。



您是否也想體驗這種輕鬆的檢索系統呢？歡迎點選此申請免費試用！

資訊檢索白話文運動–自然語言檢索(Nature Language)

在五四運動中，透過白話文的推廣，讓知識的流通更快速﹔今天，我們則是透過自然語言的檢索技術，讓資訊檢索的學習門檻更低，資訊獲得的速度更快。

以往，我們往往為了查詢一個主題，可能要透過好幾個輪迴的檢索過程，才能確認挑選出我們所需要的資訊。譬如「為什麼太陽光紫外線的曝曬會使罹患皮膚癌的風險增加?」。首先，必須先挑出可以作為查詢點的關鍵字，譬如「紫外線(UV)」和「皮膚癌(Skin Cancer)」。

但是我們會發現，當我們在作查詢時，我們可能使用的關鍵字是簡稱，譬如紫外線的簡稱是UV；可能是一般的稱呼，譬如Skin Cancer是一般的通稱，真正的醫學標題是Skin Neoplasms。我們必須先去知道正式的名稱或是所有相關的同義辭彙，譬如Cancer這個字還可能以Tumor、Neoplasms、Carcinoma等等的字詞代表。

在Ovid Medline的查詢中，因為有MeSH的主題辭彙分類，我們可以透過Ovid系統中的Mapping Subject Headings的方式來精確我們的查詢結果。

但是如果我們需要去查詢電子書時，沒有了MeSH的輔助，我們靠什麼方式快速有效的查到我們要的資訊呢?

此時，自然語言檢索(Nature Language)也就運應而生了。我們不再需要把一個問題拆成好幾個關鍵詞分開查詢，而是直接輸入一個問題，像是「Why UV from sun light increase the risk of skin cancer?」。

以Books@Ovid為例，Ovid會將讀者輸入的詞彙作所有可能詞性或詞態變化的查詢，再依據每個關鍵字彼此之間的距離計算關聯度，最後提供最接近問題的答案。


我們只要看看系統提示的內文片段是否和我們的需求符合，確定之後，點選Ovid Full Text就可以直接連結到電子書的內文瀏覽。


我們所選擇的內容會明顯的標示出來，包括我們輸入的字詞和該篇文章所在的章節段落，都可以一次呈現。除了線上瀏覽之外，為了方便讀者對於內容的引用所需，文章段落中的參考文獻都可以透過連結的方式直接連結。



再加上參考文獻的對外連結功能，資料庫和電子期刊資料一次到位。

這樣的功能除了提供Books@Ovid的讀者來使用之外，臨床決策支援系統ClinicallResource@Ovid現在也同步提供。


現在看起來，查資料一點都不困難了，不是嗎? 連動輒上千頁的書籍，利用自然語言檢索的方式，彈指之間就可以找到我們需要的資料。由於資訊檢索技術的再突破，我們可以把更多的時間放在實際的研究工作或是醫療照護上面，知識的腳程又往前加快了許多。